ملوان در سـال 1347 و فقط در رشتة فوتبال توسط نيروي دريايي فعاليت خود را آغاز نمود.بهمن صالح نیا به همراه چند جوان ورزشکار شهر بندری انزلی، باشگاه فوتبالی را تاسیس کرد. پس از گذشت مدتی، نیروی دریایی ایران تصمیم به خرید این باشگاه و حمایت مالی از آن گرفت.صالح نیا که در اصل موسس این باشگاه بود، به عنوان مربی تیم فوتبال باشگاه نیز از سال 1352 تا 1377 فعالیت کرد. پس از پيروزي انقلاب اسلامي با تغيير نوع نگرش به اهداف و فعاليت هاي آن و صرفاً در راستاي تعميم و گسترش ورزش , سالم سازي جوانان و محيط و مقابله با تهاجم فرهنگي , بستر سازي محيط براي رشد و شكوفائي استعدادهاي بالقوه و غني ورزش جوانان برومند و غيرتمند منطقة و تقويت روحيه و منش جوانمردي و نشاط و شادابي باشگاه ملوان با حمايت هاي همه جانبه معنوي , مالي , تشكيلاتي و اداري نيروي دريايي سرافراز جمهوري اسلامي ايران فعالتر و در حال حاضر ضمن فعال بودن تيم فوتبال بزرگسال ، تيم هاي فوتبال اميد- جوانان – نوجوانان- نونهالان ـ مدرسة فوتبال در رده هاي سني مختلف و همچنين تيم فوتبال بانوان در ليگ برتر نيز فعاليت دارند. ملوان انزلی سه بار جام حذفی را در پرونده خود ثبت کرده و بازیکنانی نظیر مرحوم سیروس قایقران، محمد احمدزاده و غفور جهانی از این تیم به فوتبال ایران معرفی شدند. این تیم درفصل 91-1390 با هدایت فرهاد پورغلامی علاوه بر درخشش درلیگ برتر تا دیدارنهایی جام حذفی هم پیش رفت وعلی رغم پیروزی یک به صفر برابر پرسپولیس دردیدار برگشت درعین شایستگی از دست یابی به جام محروم شد.ملوان انزلي در فصل 92-1391 دچار بحران مالي به جهت تعيين مالكيت اين تيم به بخش خصوصي شد ونتايج مطلوبي درليگ برتر كسب نكرد وبا 39 امتيازبه مقام پانزدهم دست يافت.
درنهايت در تيرماه سال 91، با واگذاري اين تيم به بخش خصوصي محمد صادق درودگر به عنوان مديرعامل جديد ملوان انزلي انتخاب شد.
افتخارات تيم فوتبال ملوان به شرح ذيل مي باشد:
1 - ورود به مسابقات دستة اول جام تخت جمشيد سال1351 2- مقام پنجم و بهترين تيم شهرستاني جام تخت جمشيد سال1352 3- مقام دوم جام عمران منطقه اي پاكستان سال1352 4- مقام ششم جام تخت جمشيد سال1353 5- مقام هفتم جام تخت جمشيد سال1354 6- مقام هفتم وبهترين تيم شهرستاني جام تخت جمشيد سال1355 7- مقام اول اولين دورة جام حذفي سال 1355 8- مقام سوم وبهترين تيم شهرستاني جام تخت جمشيد سال1356 9- مقام سوم جام وحدت (كشورهاي سوريه - الجزاير – استقلال – پيروزي – اميد ارتش هاي ايران ) سال 1360 10- مقام اول دومين دورة جام حذفي سال 1365 11- نمايندة ايران در مسابقات جام در جام آسيا در كشور سريلانكا كه مقام قهرماني گروه را كسب نمود . 12- مقام دوم سومين دورة جام حذفي سال 1366 13- مقام دوم چهارمين دورة جام حذفي سال 1367 14- مقام اول پنجمين دورة جام حذفي و اعزام به مسابقات آسيايي در سال 1369 15-مقام اول دستة دوم ليگ آزادگان سال 1375 16- مقام دوم دستة دوم ليگ آزادگان در سال 1378 و صعود به ليگ برتر 17- شركت در اولين دورة مسابقات آسيائي و آفريقائي كشور هندوستان در سال 1382 18- مقام دوم مسابقات ليگ فوتبال دسته يكم كشور در فصل ورزشي 1383- 1382 و صعود به ليگ برتر.
19- نايب قهرمان جام حذفي درفصل 91-1390
رنگ لباس اول: پیراهن سفید-آبی / شورت سفید رنگ لباس دوم: پیراهن آبی-سفید / شورت آبی
